При ошибке доступа к сетвым сервисам на линуксе имеет смысл проверить не блокирует ли порты фаервол. Имеет смысл остановить его и проверить работусервиса.
Метка: iptables
Tunnel IPIP between RouterOs and Linux
Мини инструкция. Поднимем ip tunnel между микротиком и линуксом ( ip-ip tunnel)